第一百四十三章 生化分析器
分子尺度的细胞模型，是各所大学的生物实验室一直努力建立和完善的东西。
二百年前的二十一世纪，大约2034年前后的时候，神州大地的大学与研究所，拥有的分子级别生物模型的数量，是〇。
生物力学实验室的存在历史不超过七十年。即使是在大神州，细胞模型做得最早和最丰富的，也绝非生物力学实验室。
不过，他们实验室的海鞘模型，崭崭新，足够精细。因为年轻，所以先进。不仅仅是分子尺度的细胞模型，而且是分子级别的生物体整体模型。
模型构建者兰泽吹嘘，他可以利用附带的计算工具，对海鞘细胞进行任意的功能修改。只要用生物化学规则计算出相应的DNA序列嵌入到原来的染色体中，就可以达到修改可遗传的效果。
现有的做DNA设计的实验室，做到的事情，也就是利用基因库拼装新细胞的DNA。做得好的几家都是基因库积累比较强大的。
“你这个厉害了嘛！”仙女这么说来着。
老罗教授专门召集实验室全体人员，包括忙的、闲的、打杂的、日常进来溜达的，开了个会。
他对全世界宣布，本实验室的海鞘数学模型暨海鞘数据动态库可以用了。欢迎同行来，要么膜拜要么砸场子。
这个会开得，门都不关。
仙女等散会才进来找兰泽。
兰泽身边正围着一帮学弟学妹，个个眼中闪着膜拜的星光。以前在体育总馆玩模拟器，他经常被膜拜，所以挺习惯的。
“还可以吧。”兰泽不带谦虚的。
“可以修改细胞的话，如果我们不知道功能对应的基因是什么，怎么改呢？”勤学好问的混实验室的大四小师妹问。
“算嘛。”
“算什么？”师妹一脸萌萌哒。
“用功能蛋白质计算DNA呀。”兰泽理所当然地说。
“哎？可以编程了？”仙女恍然大悟。
兰泽沉思半晌，“你这个想法好啊。”
仙女一说，他才意识到，利用分子间作用力反推计算DNA序列这件事，根本上就是编程嘛！
用电脑玩编程，他熟得很。虽然DNA序列他没玩过，但道理大致相通，规则略有不同而已。至于同一条染色体上两端靠共振通讯，DNA大长链各种拧麻花式调节功能，这些生物大分子的特色，正是和电脑不完全一样，才有意思。不是吗？
他们实验室的楼上，以及大东研发城的研究所，都有人在做DNA编程设计。不少实验室可以在现有真核微生物的基础上，做一些特殊功能的修改。至于病毒设计，已经有少量的成熟商业应用了。
DNA和氨基酸的对照表，早在二十世纪就被人摸清楚了。光靠这个完全没法设计出生物来。正如知道铁是铁，离发明订书机还差着八百里呢。
基因库的大部分内容，实际上是关于各种条件下，细胞内的活动如何控制、如何操作的。以所谓“操纵元”为单位。大部分操纵元的部件，并不按顺序排列在一起。有时候甚至可以跨越好几条染色体。正是因为这样的复杂性，基因库中每一项新的功能单元，分析需要十分细致。基因库在历史上的积累是十分缓慢的。
没有基因库，DNA编程就没有零件。
兰泽忽然觉得，他可以再多做一点东西。比如说，写个生化分析器代替基因库？
计算一下生命相关的各种调控方式，各种功能性大分子，应该是可以做到的吧？
想到了，他就问道：
“你们几个，有没有时间，帮我做几个验证实验？”
“兰师兄，要做什么实验？”一群师弟妹踊跃扑了上来，“我来，我有空。”
“别急，实验够大家分的。”兰泽从容地说。
“我能帮上什么忙吗？”仙女笑着问。
兰泽想了想：“我想看看现有的生化分析算法长什么样。”
仙女替他筛选了一些常用而又不涉密级的生化分析算法。
兰泽回到宿舍里收到后，躺在床上慢慢看完，时间就挺晚的了。
他发现一件事，这些算法挺陈旧的。
物理学和数学并不是几百年没有进展的学科。但是这些算法，都建立在上百年前人类对世界认知的基础上。
作为一个自我感觉数学不错的人，兰泽认为，生化分析算法，他应该自己重写一遍。
现有的算法，并不太适合分析生物大分子。尤其是大型的、聚合在一起的肽链、核糖链、多肽与核糖结合在一起的复杂长链，往往具有打了结又绕在一起的结构——这些结构是很多生物功能的基础。但是现有的算法，有的处理方式和算术没什么本质区别，有的则根本不顾这些复杂结构。
原因很简单：术业有专攻。数学、物理和化学本来就是不同的领域。
主流算法久经考验，一般情况下已经足够简便好用，也用不着太先进。但用来处理生物微观活动，这些算法的效率和精度都不够。
而被国家研究部门珍藏的，有密级的生化分析算法，会是什么样，兰泽暂时也看不到。
他琢磨完了这些现有的算法，直接合上眼睛，打算睡觉来着。眼角好像闪过一抹蓝光。
于是他举起手环看了一眼，发现有延时消息。
他设置过的，张荷大学姐联络，手环闪蓝光。
“小朋友，想不想去游泳？”张大学姐的声音特别有质感。不清脆，但是说不出的好听。
这条消息，按照大学姐的设置，本该在他醒来以后，才震动提醒他查看手环，现在提前查看到了。
“想。”兰泽轻轻地回答了一个字。
“哎？几点了还不睡？”
“睡不着。”兰泽眼睛都闭上了。闭着眼说瞎话。
“睡不着，我们聊会儿天？”
“不要。”
“嗯？”
“得了。什么时候游泳？”兰泽迷迷糊糊地问。
“游泳啊……”
“快说时间。”兰泽困得不行，又特别想去游泳。不管能不能游，哪怕看看水都是好的。
“你……明天……天气……站点……风……”兰泽完全没有听清楚张荷到底说了什么。
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二百年前的二十一世纪，大约2034年前后的时候，神州大地的大学与研究所，拥有的分子级别生物模型的数量，是〇。
生物力学实验室的存在历史不超过七十年。即使是在大神州，细胞模型做得最早和最丰富的，也绝非生物力学实验室。
不过，他们实验室的海鞘模型，崭崭新，足够精细。因为年轻，所以先进。不仅仅是分子尺度的细胞模型，而且是分子级别的生物体整体模型。
模型构建者兰泽吹嘘，他可以利用附带的计算工具，对海鞘细胞进行任意的功能修改。只要用生物化学规则计算出相应的DNA序列嵌入到原来的染色体中，就可以达到修改可遗传的效果。
现有的做DNA设计的实验室，做到的事情，也就是利用基因库拼装新细胞的DNA。做得好的几家都是基因库积累比较强大的。
“你这个厉害了嘛！”仙女这么说来着。
老罗教授专门召集实验室全体人员，包括忙的、闲的、打杂的、日常进来溜达的，开了个会。
他对全世界宣布，本实验室的海鞘数学模型暨海鞘数据动态库可以用了。欢迎同行来，要么膜拜要么砸场子。
这个会开得，门都不关。
仙女等散会才进来找兰泽。
兰泽身边正围着一帮学弟学妹，个个眼中闪着膜拜的星光。以前在体育总馆玩模拟器，他经常被膜拜，所以挺习惯的。
“还可以吧。”兰泽不带谦虚的。
“可以修改细胞的话，如果我们不知道功能对应的基因是什么，怎么改呢？”勤学好问的混实验室的大四小师妹问。
“算嘛。”
“算什么？”师妹一脸萌萌哒。
“用功能蛋白质计算DNA呀。”兰泽理所当然地说。
“哎？可以编程了？”仙女恍然大悟。
兰泽沉思半晌，“你这个想法好啊。”
仙女一说，他才意识到，利用分子间作用力反推计算DNA序列这件事，根本上就是编程嘛！
用电脑玩编程，他熟得很。虽然DNA序列他没玩过，但道理大致相通，规则略有不同而已。至于同一条染色体上两端靠共振通讯，DNA大长链各种拧麻花式调节功能，这些生物大分子的特色，正是和电脑不完全一样，才有意思。不是吗？
他们实验室的楼上，以及大东研发城的研究所，都有人在做DNA编程设计。不少实验室可以在现有真核微生物的基础上，做一些特殊功能的修改。至于病毒设计，已经有少量的成熟商业应用了。
DNA和氨基酸的对照表，早在二十世纪就被人摸清楚了。光靠这个完全没法设计出生物来。正如知道铁是铁，离发明订书机还差着八百里呢。
基因库的大部分内容，实际上是关于各种条件下，细胞内的活动如何控制、如何操作的。以所谓“操纵元”为单位。大部分操纵元的部件，并不按顺序排列在一起。有时候甚至可以跨越好几条染色体。正是因为这样的复杂性，基因库中每一项新的功能单元，分析需要十分细致。基因库在历史上的积累是十分缓慢的。
没有基因库，DNA编程就没有零件。
兰泽忽然觉得，他可以再多做一点东西。比如说，写个生化分析器代替基因库？
计算一下生命相关的各种调控方式，各种功能性大分子，应该是可以做到的吧？
想到了，他就问道：
“你们几个，有没有时间，帮我做几个验证实验？”
“兰师兄，要做什么实验？”一群师弟妹踊跃扑了上来，“我来，我有空。”
“别急，实验够大家分的。”兰泽从容地说。
“我能帮上什么忙吗？”仙女笑着问。
兰泽想了想：“我想看看现有的生化分析算法长什么样。”
仙女替他筛选了一些常用而又不涉密级的生化分析算法。
兰泽回到宿舍里收到后，躺在床上慢慢看完，时间就挺晚的了。
他发现一件事，这些算法挺陈旧的。
物理学和数学并不是几百年没有进展的学科。但是这些算法，都建立在上百年前人类对世界认知的基础上。
作为一个自我感觉数学不错的人，兰泽认为，生化分析算法，他应该自己重写一遍。
现有的算法，并不太适合分析生物大分子。尤其是大型的、聚合在一起的肽链、核糖链、多肽与核糖结合在一起的复杂长链，往往具有打了结又绕在一起的结构——这些结构是很多生物功能的基础。但是现有的算法，有的处理方式和算术没什么本质区别，有的则根本不顾这些复杂结构。
原因很简单：术业有专攻。数学、物理和化学本来就是不同的领域。
主流算法久经考验，一般情况下已经足够简便好用，也用不着太先进。但用来处理生物微观活动，这些算法的效率和精度都不够。
而被国家研究部门珍藏的，有密级的生化分析算法，会是什么样，兰泽暂时也看不到。
他琢磨完了这些现有的算法，直接合上眼睛，打算睡觉来着。眼角好像闪过一抹蓝光。
于是他举起手环看了一眼，发现有延时消息。
他设置过的，张荷大学姐联络，手环闪蓝光。
“小朋友，想不想去游泳？”张大学姐的声音特别有质感。不清脆，但是说不出的好听。
这条消息，按照大学姐的设置，本该在他醒来以后，才震动提醒他查看手环，现在提前查看到了。
“想。”兰泽轻轻地回答了一个字。
“哎？几点了还不睡？”
“睡不着。”兰泽眼睛都闭上了。闭着眼说瞎话。
“睡不着，我们聊会儿天？”
“不要。”
“嗯？”
“得了。什么时候游泳？”兰泽迷迷糊糊地问。
“游泳啊……”
“快说时间。”兰泽困得不行，又特别想去游泳。不管能不能游，哪怕看看水都是好的。
“你……明天……天气……站点……风……”兰泽完全没有听清楚张荷到底说了什么。
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